He leido en Despues de Google que ha salido una versión de Chrome con soporte de Flash ya integrado. Asi que lo primero que he hecho ha sido actualizarme a la ultima version de Chromium (no uso Chrome) y como tengo los PPA de desarrollo actualizo con:
$ sudo apt-get update
$ sudo aptitude install chromium-browser
Por desgracia no he podido comprobar si Chromium lleva o no ya el soporte de Flash integrado, pues tengo ya otros plugins instalados, pero lo que si he podido ver es que tenia hasta 4 plugins de Flash habilitados !!!!, Caray!, no se si eso me da o no da problemas (puede que Chrome solo use el primero de ellos y de igual), pero lo mejor que he podido hacer es deshabilitar tres y quedarme solo con uno.
Lo haces escribiendo en la barra de direcciones: “about:plugins“, entonces aparece el administrador de plugins que te indica que plugins tienes instalados, en que ruta se encuentra ese plugin y su nombre (son ficheros con extension .so) y ademas te permite habilitar o deshabilitar el plugin.