
Para poner Ubuntu totalmente transparente hay que hacer lo siguiente. Lo primero es instalar el Administrador de Opciones CompizConfig esto lo hacemos desde una terminal con:
sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
Una vez instalado lo ejecutamos desde “Sistema >> Preferencias >> Administrador de Opciones CompizConfig”. Ahí tenemos que activar el modulo de “Opacity, Brightness and Saturation”.

Estos son los items que debes añadir:
DropdownMenu
normal
dialog
menu
popupmenu
tooltip
notification
utility
name=gnome-panelUna vez añadidos todos los items listados anteriormente y regulado la transparencia a gusto para cada uno de ellos tendremos Ubuntu completamente transparente.