Por suerte en Linux siempre existe una herramienta para solucionar nuestros problemas, para este caso de archivos duplicados tenemos el software: duff

Pueden encontrarlo en su repositorio, en distros como Debian o basadas en él un simple: sudo apt-get install duff les bastará para instalarlo, en ArchLinux imagino que sea sudo pacman -S duff

Una vez lo instalamos usarlo es realmente muy simple, por ejemplo yo buscaré todos los archivos duplicados en mi carpeta Pictures (/home/kzkggaara/Pictures/):

duff -r /home/kzkggaara/Pictures

El parámetro -r es para que busque recursivamente y luego solo queda definir en qué carpeta debe buscar, en este ejemplo /home/kzkggaara/Pictures

Esto les mostrará algo como: